一、需要注销的南京子公司有哪些：
公司撤销或者公司决定撤销南京子公司的，应当自撤销决定作出之日起30日内向该子公司的公司登记机关申请注销登记。
二、子公司注销登记程序：
1. 自做出注销决定之日起15日内成立清算组;
2. 清算组自成立之日起10日内通知债权人，并于60日内在报纸上至少公告三次;
3. 清偿子公司债务，到税务部门办理完税证明;
4. 填写注销登记申请书，提交登记文件、证件，按约定日期领取核准通知书。
三.、子公司注销登记应提交的文件、证件：
1. 子公司注销登记申请书;
2. 股东会依照《公司法》作出的解散决定;
3. 股东会确认的清算报告;
4. 清算组织成立后60日内在报纸上公告三次的报样;
5. 税务部门出具的完税证明;营业执照正、副本
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公司撤销或者公司决定撤销杭州子公司的，应当自撤销决定作出之日起30日内向该杭州子公司的公司登记机关申请注销登记。可是到登记机关办理注销登记应该提交哪些材料呢?本文为您解答。
1、公司清算组负责人签署的《(内资)公司注销登记申请书》(加盖公司公章或提交公章缴销证明)(原件1份)(本表)
2、企业申请登记委托书(原件1份)(可在本表内填写)
3、经办人身份证明(复印件1份，验原件);由企业登记代理机构代理的，同时提交企业登记代理机构营业执照(复印件1份，须加盖本企业印章，并注明“与原件一致”)
4、关于决定注销的文件(原件1份)
5、清算组成员《备案确认通知书》(原件1份)
6、经确认的清算报告(原件1份)
7、企业法人营业执照正本(原件)和全部副本(原件)
8、在报纸上登载的清算公告(原件1份)
9、有子公司的公司申请注销的，还应提交子公司注销登记证明
10、法律、行政法规规定应当提交的其他文件
上述就是子公司注销登记应该提交的材料，但是子公司的注销涉及到各方利益，所以一定要做好清算工作和债务清偿工作。只有按照法律的规定办理了相应的债务清偿或者公告手续，管理机关才会受理注销登记。
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